MBG 513 is about turning biological data into answers, learning how to ask the right computational questions of genomes, transcriptomes, and protein networks rather than just running tools blindly. You'll spend most of your time in R (tidyverse plus Bioconductor) working through NGS pipelines, differential expression, clustering, dimension reduction, and functional enrichment, with hands-on practice reinforced by take-home exams, five homeworks, and a presentation tied to a primary-literature reading. Coming in with molecular biology fundamentals, this is the course that bridges wet-lab thinking and data science, and it's the foundation almost any modern MBG thesis or downstream omics work will lean on.
→ STARS müfredatı (resmi syllabus)
Son 17 dönemde dersin ortalaması 3,78 (239 öğrencinin notu, 4,00 üzerinden), yani sınıf ortalaması A- civarında. Zorluk hocaya ve şubeye göre değişir; ölçülebilir olan bu sayı. Diğer derslerle karşılaştır →
İzlencede 1 midterm var, ağırlığı %30. Final %30. Kalan %40 dersin öteki kalemlerinde. Tam dağılım aşağıda.
Bilkent kataloğunda bu ders için ön koşul yazılı değil.
İzlencede zorunlu kitap: Class Notes. İzlence toplam 5 kaynak sayıyor.
3 Bilkent kredisi, 5 AKTS.
| Kalem | Ağırlık | Notun (100 üzerinden) |
|---|---|---|
| 1 midterm 30 pts | %30 | |
| Final Project R based | %30 | |
| R practice in lab and worksheets | %20 | |
| paper presentation | %20 |
Ağırlıklar MBG 513 izlencesinden. Hocanın bu dönemki dağılımı farklı olabilir; bağlayıcı olan ders izlencesidir. Harf notu sınırlarını hoca belirliyor, o yüzden hedefi sen giriyorsun. İzlencede FZ şartı var, sayfanın sonundaki kutuda.
Bilkent'in resmî syllabus'ünden. Sağdaki etiket o çıktının hangi değerlendirmeyle ölçüldüğünü söylüyor.
İlk dosyayı sen atarsan: not, slayt, geçmiş sınav, çözüm, cheat-sheet, ne varsa. defter ekibi öğrenci paylaşımlarından bu dersin notlarını yazar. Drive linki / PDF / ZIP, hepsi olur.
| Dönem | Ders ort. | |
|---|---|---|
| 2025-2026 Spring | 3.81 | 1 şube · 34 öğr |
| 2024-2025 Spring | 3.89 | 1 şube · 22 öğr |
| 2023-2024 Spring | 3.90 | 1 şube · 21 öğr |
| 2022-2023 Spring | 3.92 | 1 şube · 15 öğr |
| 2021-2022 Spring | 3.93 | 1 şube · 17 öğr |
| 2020-2021 Spring | 3.96 | 1 şube · 7 öğr |
| 2019-2020 Spring | 3.88 | 1 şube · 14 öğr |
| 2018-2019 Spring | 3.36 | 1 şube · 7 öğr |
| 2017-2018 Spring | 3.61 | 1 şube · 16 öğr |
| 2016-2017 Spring | 3.68 | 1 şube · 11 öğr |
Dersin dönem ortalaması, o dönemin bütün şubeleri birlikte. Kaynak STARS'ın ders değerlendirme raporu. Rapor yalnız kampüs ağından ya da Bilkent VPN ile açılıyor: MBG 513 raporu · Bilkent VPN bilgisi. Öğrenci anket cevaplarını defter'de tutmuyoruz. Tüm derslerin ortalamaları →
Course Learning Outcomes: Course Learning Outcome Assessment access online databases 1 midterm 30 pts R practice in lab and worksheets practice sequence alignment, phylogeny and motif finding 1 midterm 30 pts apply online tools for a biological problem 1 midterm 30 pts R practice in lab and worksheets analyze DNA sequences 1 midterm 30 pts R practice in lab and worksheets apply univariate statistics to biological data 1 midterm 30 pts R practice in lab and worksheets extract data from genomic and transcriptomics databases 1 midterm 30 pts Final Project R based R practice in lab and worksheets paper presentation read a paper on bioinformatics Final Project R based R practice in lab and worksheets present a recent paper on a database/webtool paper presentation practice basics of R programming language R practice in lab and worksheets write a basic R program for a biological problem R practice in lab and worksheets